Исторические вехи
Новый отсчёт церковной жизни в Кирилло-Белозерском монастыре начался с 21 июня 1991 года – дня малого освящения церкви Усекновения главы Иоанна Крестителя. Оно было совершено настоятелем приходской церкви Святого Богоявления в Ферапонтовском монастыре иеромонахом Арсением.
Спустя несколько месяцев, 4 ноября, в церкви преподобного Сергия Радонежского была отслужена архиерейская литургия, возглавленная архиепископом Вологодским и Великоустюжским Михаилом. Весной 1992 года этот храм становится действующим храмом для православного прихода, созданного при Казанском соборе. Регулярные богослужения в нём начались в день памяти равноапостольных Кирилла и Мефодия, 24 мая.
22 июня 1993 года, в день памяти преподобного Кирилла, епископ Вологодский и Великоустюжский Максимилиан впервые совершает литургию и крестный ход вокруг обители. С этого же года архиерейское богослужение, крестный ход и водосвятный молебен на Сиверском озере становятся традицией.
2 августа 1995 года Комитет по управлению имуществом Вологодской области на основании совместного решения Госкомимущества РФ и Министерства культуры РФ от 29.06.1995 г. передал Русской православной церкви комплекс Малого Иоанновского монастыря в безвозмездное бессрочное пользование.
14 мая 1997 года на празднество иконы Божией Матери «Нечаянная радость» епископ Максимилиан и директор Кирилло-Белозерского музея-заповедника Г.О. Иванова подписали охранный договор на передачу Малого (Горнего) Иоанновского монастыря с храмами Иоанна Предтечи и Сергия Радонежского для возрождения монашеской жизни.
19 октября 1998 года на очередном заседании Священный Синод благословил открытие Кирилло-Белозерского монастыря.
За годы возрождения монашеской жизни обителью в качестве наместников и исполняющих его обязанности руководили: иеромонах Кирилл (Петрович) (1998 – 2001); иеромонах Лаврентий (Середнев) (2001 – 2006); иеромонах Игнатий (Молчанов) (2006 – 2015): с 2007 г. – игумен, с 2009 года назначен наместником монастыря; игумен Анастасий (Додарчук) (с 2016 и по сей день).
Всего в Кирилло-Белозерском мужском монастыре сейчас проживает десять человек, из которых в священном сане пять монахов: четыре иеромонаха и один дьякон. Монастырь принимает паломников и трудников. Для них за пределами монастыря есть странноприимный дом на десять человек, рядом с монастырскими стенами.
Монастырь, основанный преподобным Кириллом в 1397 году, и сейчас живёт по древнему общежительному порядку. Каждый день в нём совершаются богослужения.
Рака с мощами преподобного Кирилла находится в храме, названном в его честь и выстроенном над местом захоронения. Там проходит основная часть всех богослужений. Летом по воскресным дням и двунадесятым праздникам богослужения по договорённости с руководством Кирилло-Белозерского музея-заповедника совершаются в Успенском соборе – главном храме Кирилло-Белозерского монастыря, а в престольные праздники – в храме Усекновения главы Иоанна Предтечи и преподобного Сергия Радонежского.
Наместник монастыря игумен Анастасий
Святыни монастыря
В храме преподобного Кирилла под спудом почивают мощи преподобного основателя обители.
На месте первого поселения преподобного поставлены каменные сени, в которых находится деревянная часовня, рубленая, по преданию, самим преподобным Кириллом, и крест, водруженный им при поселении.
Возле алтаря Успенского собора погребён выдающийся настоятель обители XIX века – преподобный Иаков Кирилловский (день памяти 29 января). На месте захоронения установлен мраморный памятник.
В шести километрах от монастыря, на горе Мауре, где преподобный Кирилл узнал место для поселения, указанное в видении Богородицей, поставлен поклонный крест.
В двадцати минутах ходьбы от монастыря, на горе Золотуха (ул. Строителей, д. 56-а), находится часовня Новомучеников Кирилловских, расстрелянных на этом месте 15 сентября 1918 года: священномученика Варсонофия, епископа Кирилловского, одного из последних настоятелей обители, преподобномученицы Серафимы и мучеников Николая Бурлакова, Анатолия Барашкова, Михаила Трубникова и Филиппа Марышева. На гору Золотуху каждый год 15 сентября, в день их памяти, верующие вместе с братией обители совершают крестный ход.