В Старом Симоновом монастыре в Москве, где Кириллу явилась Божия Матерь, указавшая ему путь на Белоозеро, в XVI веке был устроен храм его имени. В конце XVIII века эта церковь была за ветхостью разобрана, а престол перенесён в храм Рождества Богородицы. Сегодня это единственный в столице престол в честь преподобного Кирилла Белозерского.
В XVII веке каменный собор Рождества Богородицы после упразднения Старого Симонова монастыря стал приходским храмом. В 1928 году был закрыт, но в 1989 году возвращён Русской Православной Церкви, а в 1993 году Патриарх Московский и всея Руси Алексий II освятил главный престол храма. На месте явления Божией Матери Кириллу устроена часовня.